ISSR-PCR kao jednostavna dijagnostička metoda za razlikovanje kriptičnih vrsta Nannospalax leucodon (Spalacinae, Rodentia)
ISSR-PCR као једноставна дијагностичка метода за разликовање криптичних врста Nannospalax leucodon (Spalacinae, Rodentia)
2022
Authors:
Đokić, MarkoStamenković, Gorana
Jojić, Vida
Ćosić, Nada
Ćirović, Duško
Savić, Ivo
Bugarski-Stanojević, Vanja
Contributors
Živić, MiroslavPetković, Branka
Document Type:
Conference object (Published version)
,
© 2022 by the Serbian Biological Society
Metadata
Show full item recordAbstract:
Vrste slepog kučeta iz roda Nannospalax se, pored brojnih adaptacija na podzemni način života, karakterišu i izraženom varijabilnošću kariotipa. Do sada su opisane čak 74 različite hromozomske forme (HF), ali su zvanično priznate samo tri vrste.1 Svaka je zapravo kompleks vrsta sa statusom „nedovoljno podataka“ na IUCN Red List of Threatened Species. Evropske vrste ovog roda sačinjavaju kompleks N. leucodon supersp.1 Među njima je više od 20 različitih HF, od kojih je pet (hungaricus, serbicus, montanoserbicus, syrmiensis, montanosyrmiensis) prisutno u Srbiji, a poslednje dve se vode kao ugrožene.2 Iako su međusobno reproduktivno izolovane i filogenetski udaljene, zbog nedostatka morfoloških razlika predstavljaju kriptične vrste. Sa konzervacionog aspekta je veoma važno vršiti monitoring njihovih populacija i utvrditi areale rasprostanjenja. Stoga je neophodno razviti pouzdanu i neinvazivnu metodu za njihovu efikasnu determinaciju. Inter Simple Sequence Repeat ˗ Polymerase Chain Reaction (ISSR-PCR) tehnika, koja produkuje ISSR markere – anonimne sekvence DNK ograničene invertovanim tandemskim ponovcima, se pokazala kao korisna u identifikaciji morfološki sličnih vrsta kod nekoliko sisarskih taksona.3 Od 11 različitih ISSR prajmera testiranih na prisustvo fragmenata DNK specifičnih za vrstu, na ukupnom uzorku od 25 jedinki, tri prajmera (CAA)5GC; (CAG)4AC i (GA)8AC su dala informativne profile DNK, obezbeđujući pouzdano i jasno prepoznavanje svih pet analiziranih kriptičnih vrsta.
Funding / projects:
- Ministry of Science, Technological Development and Innovation of the Republic of Serbia, institutional funding - 200007 (University of Belgrade, Institute for Biological Research 'Siniša Stanković') (RS-MESTD-inst-2020-200007)
In:
- Živić M, Petković B, editors. Knjiga sažetaka: Treći Kongres biologa Srbije: Osnovna i primenjena istraživanja: Metodika nastave; 2022 Sep 21-25; Zlatibor, Serbia. Belgrade: Serbian Biological Society; 2022. p. 106.